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精准营养与代谢团队揭示哺乳动物性染色体剂量补偿的调控和演化
作者:钱胜编辑:黄玮审核:陈振夏发布时间:2022-09-01

南湖新闻网讯(通讯员 钱胜)8月27日,我校生命科学技术学院、生物医学与健康学院、湖北洪山实验室陈振夏教授课题组研究成果以“Dynamic Spatial-temporal Expression Ratio of X Chromosome to Autosomes but Stable Dosage Compensation in Mammals”在基因组学期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics发表。研究全面验证了哺乳动物性染色体演化过程中X染色体上基因的表达上调以抵消Y染色体的退化,并揭示了X染色体和常染色体基因表达比值的组织特异性和时期动态性。

在哺乳动物性染色体演化过程中,Y染色体逐步退化,导致X染色体上连锁的基因在雄性中变成单倍体,而在雌性(XX)中维持着两条X染色体,引起基因组中基因剂量的不平衡。据此,演化遗传学家Susumu Ohno提出剂量补偿假说——X连锁基因的表达加倍以补偿雄性(XY)中X染色体的剂量减少,同时雌性(XX)中一条X染色体失活以避免形成X-四体,从而实现两性之间基因表达水平的平衡。近些年来随着高通量测序技术的发展,一些研究通过微阵列和RNA测序报道了某些哺乳动物组织中的X染色体上调(X:AA比值~1),为Ohno的假说提供了支持。然而,也有一些研究向Ohno假说提出了挑战,这些研究仅包含了有限的组织和某些发育时期,导致观测结果的不稳定性甚至产生相反的结论。

为了全面探究哺乳动物剂量补偿的模式,研究人员整合了公开的涵盖多个组织、发育时期和物种的发育转录组数据、翻译组和蛋白质组数据,对其调控和演化进行了系统的探究。

研究人员首先发现X染色体和常染色体上基因表达比值(X:AA 比值)呈现出组织特异性,在组织发育的早期接近1并随着发育过程动态变化。比较人类和其他陆生脊椎动物的直系同源基因的表达水平,研究人员发现人的X染色体在演化过程中维持着基因表达的平衡,而并非此前报道的表达水平减半。最后,进一步整合分析转录组和表观基因组学数据发现,不同的表观遗传调控塑造了X染色体上基因强烈的时空特异性表达,并最终影响了X:AA比值。

我校生命科学技术学院、生物医学与健康学院、湖北洪山实验室博士生钱胜为论文第一作者,陈振夏教授为论文通讯作者。该项工作得到了国家自然科学基金、中国淡水生态与生物技术国家重点实验室开放基金、中央高校基本科研专项资金、华中农业大学科技自主创新基金等项目的资助。

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